Datascientist antibioticaresistentie

Als data scientist bouw en moderniseer je de datapipelines die antibioticaresistentie in Nederland in kaart brengen. In deze rol combineer je de verdieping van complexe data-puzzels in R met de dynamiek van nauwe samenwerking met epidemiologen en medisch specialisten. Je krijgt de vrijheid om bestaande SAS-processen slim te herstructureren naar schaalbare code. Binnen een maatschappelijk gedreven omgeving ontwikkel je jezelf zo door op het snijvlak van data science en epidemiologie, terwijl jouw werk bijdraagt aan besluiten over de nationale volksgezondheid. Lees verder om te ontdekken of deze functie bij jou past.

Wat ga je doen
Je werkt als data scientist aan het in kaart brengen van antibioticaresistentie in Nederland. Het RIVM verzamelt hiervoor gegevens via het Infectieziekten Surveillance Informatie Systeem – Antimicrobiële Resistentie (ISIS-AR). In dit systeem komen data uit de dagelijkse diagnostiek van Nederlandse medisch-microbiologische laboratoria samen. Jij bouwt, moderniseert en automatiseert de gegevensstromen en pipelines die van deze ruwe laboratoriumdata heldere inzichten maken.

Het grootste deel van de werkweek werk je binnen de afdeling Zorggerelateerde Infecties en Antimicrobiële resistentie (ZIA). Samen met epidemiologen zet je bestaande data-pipelines die nu nog in SAS draaien om naar de programmeertaal R. Je schrijft scripts voor datatransformatie en vertaalt gegevens naar duidelijke tabellen, grafieken, kaarten en rapporten. Een concreet resultaat van dit werk is bijvoorbeeld te zien in de jaarlijkse overzichten van het rapport NethMap One Health 2025.

Ongeveer één dag per week sluit je aan bij je directe collega-data scientists van de afdeling Data, Innovatie en Signalering (DIS). Binnen DIS werk je aan het technisch versterken van de packages en standaarden die het hele centrum Epidemiologie en Surveillance van Infectieziekten (EPI) gebruikt. Hierbij maak je gebruik van hulpmiddelen zoals Tidyverse voor datapipelines, GitLab voor versiebeheer, R Markdown voor automatische rapportages en R Shiny voor dashboards.

Hoe jouw werk er in de praktijk uitziet: Je verdiept je in een reeks complexe SAS-scripts die worden gebruikt om laboratoriumuitslagen te interpreteren. Met jouw ervaring in R zie je hoe dit proces sneller kan en waar dubbel werk wordt gedaan. Je ontwerpt generieke functies om deze processen te bundelen en stemt deze aanpak af met de betrokken epidemiologen. Wanneer blijkt dat verschillende laboratoria hun gegevens net anders aanleveren, pas je de code aan. Je herkent de patronen in de afwijkende data en bouwt de R-functies zo op dat ze flexibel omgaan met deze verschillen. Zo zorg je voor betrouwbare en herbruikbare code die voldoet aan onze interne kwaliteitsstandaarden.

Bij deze werkzaamheden krijg je de ruimte om te vernieuwen, waardoor er volop gelegenheid is om kennis en expertise op te bouwen op het snijvlak van epidemiologie en data science. Je werk gaat direct over het bewaken van antibioticaresistentie in Nederland. In de werkzaamheden zit een mooie mix van samenwerking en projectdynamiek en de mogelijkheid om in diepe focus aan concrete oplossingen te werken. Via die oplossingen draag jij bij aan een belangrijke transitie om nog efficiënter, robuuster en toekomstbestendig te gaan werken!

Over het team
Bij het RIVM werken bijna 3.000 collega’s elke dag samen aan de zorg voor morgen. Het centrum Epidemiologie en Surveillance van Infectieziekten (EPI) heeft tot doel om de gezondheid van Nederland op het gebied van infectieziekten te analyseren en te bewaken. Vanuit de afdeling DIS ondersteunen we met 25 medewerkers de rest van het centrum op het gebied van data science, data management, data engineering,rapportages en privacy compliance. Je werkt nauw samen met de afdeling ZIA, een multidisciplinair team van artsen, epidemiologen en deskundigen infectiepreventie.

De werksfeer binnen beide teams is open, vriendelijk, gedreven en nieuwsgierig. Iedereen is druk bezig met uiteenlopende projecten, maar staat toch open voor vragen en springt bij als dit nodig is. Jouw collega’s zijn over het algemeen zeer leergierig; innovatie en nieuwe ideeën worden aangemoedigd. Een goede, ontspannen werksfeer wordt bevorderd door een dagelijkse lunchwandeling in het bos, werkuitjes en borrels. Naast de werkdagen op kantoor (minimaal 2 dagen per week) is er ook ruimte om vanuit huis te werken en zo jouw privé-werk balans optimaal in te richten.

Meer informatie
Wil jij hieraan meewerken in de functie van data scientist? Heb je eerst nog vragen over deze vacature, dan kun je epidemioloog ISIS-AR Ilse Nauta (06-8655 9310) of datascience coördinator bij DIS Bo van den Bosch (06-52908001) bereiken, zij staan je graag te woord!

In de selectieprocedure, vóór het tweede gesprek, zal gebruik gemaakt worden van een programmeeropdracht. Uiterlijk 23 september kan je terugkoppeling verwachten over je sollicitatie. De eerste gesprekken vinden eind september in Bilthoven plaats.

Deze functie houdt verband met een aantal onderzoeksprojecten, die in ieder geval 12 maanden lopen. De kans is groot dat dit continueert. We komen dan ook graag in contact met kandidaten die zich voor langere tijd aan ons willen verbinden. Op dit moment kunnen wij hiervoor echter geen garantie geven. Je zult vanzelfsprekend tijdig geïnformeerd worden, over de (on)mogelijkheid om jouw arbeidsovereenkomst te verlengen.

Wat breng jij mee

• Je hebt minimaal een afgeronde hbo-opleiding in data science of een vergelijkbare richting en je hebt affiniteit met epidemiologische- of gezondheidsdata. Heb je dit niet, maar spreekt deze vacature jou wel aan, reageer dan alsnog en laat in jouw motivatie weten waarom deze vacature jou aanspreekt.
• Je hebt aantoonbare ervaring met R en Tidyverse, en idealiter ook met hulpmiddelen als R Markdown, Quarto, R Shiny, Git of Python.
• De bereidheid om bestaande SAS-scripts te leren lezen, zodat je kunt bijdragen aan de omzetting naar R. Ervaring met SAS is geen vereiste.
• Je doorgrondt zowel de hoofdlijnen als de fijnmazige details van dataprocessen en kunt hier zelfstandig keuzes in maken om de kwaliteit van de code te verhogen.
• Je bent wendbaar in je werkstijl en bent zo nodig bereid om bij een actuele crisissituatie extra bij te springen. Tijdens een infectieziekte uitbraak, zoals COVID-19, draaien we overuren en in dit soort uitzonderlijke gevallen ben je bereid extra te werken in het weekend of op feestdagen.
• Je zoekt actief de verbinding met collega's en kunt complexe technische concepten helder uitleggen aan epidemiologen en andere professionals zonder technische achtergrond. Hiervoor is het nodig dat je goed Nederlands en Engels spreekt en schrijft.

Bij het RIVM hebben we één van de beste cao's van Nederland, namelijk die van de Rijksoverheid. Naast een goed salaris hebben we aantrekkelijke arbeidsvoorwaarden zoals een Individueel Keuzebudget van 16.5 % van je bruto jaarsalaris waarover je zelf de regie hebt. Je kunt iedere maand een deel laten uitbetalen of extra vrije dagen kopen of verkopen. Daarnaast bieden we fiscale voordelen om bijvoorbeeld je studieschuld af te lossen. Ook zijn we een mantelzorgvriendelijke organisatie. Meer weten? Lees er meer over onder de kop ‘overige arbeidsvoorwaarden’.

Vragen we in de vacaturetekst om een motivatiebrief en kun je wat hulp gebruiken om deze te schrijven? Lees dan deze tips.
Informatie over solliciteren bij het RIVM:

• Wij begrijpen dat AI een handig hulpmiddel is voor jouw motivatiebrief en cv. We willen je adviseren om het louter als hulpmiddel te gebruiken en vooral ook jouw unieke ik terug te laten komen in deze documenten;
• Bij je indiensttreding vragen we altijd om een Verklaring Omtrent Gedrag (VOG);
• Als je solliciteert als 'van-werk-naar-werkkandidaat' of als 'herplaatsingskandidaat', stuur dan een kopie van je aanwijzingsbrief mee;
• Werk je nu via een uitzend- detacheringsbureau bij de Rijksoverheid, vermeld dit dan ajb in je brief;
• Het RIVM zet zich in om medewerkers in dienst te nemen die onder de doelgroep van de Wet Banenafspraak vallen. Meer weten? Klik hier;
• Bij het RIVM ben je welkom zoals je bent. Wij zijn ervan overtuigd dat diversiteit in een team de samenwerking en de uitkomst sterker maakt. Daarnaast wordt betrokkenheid van medewerkers bij medezeggenschap gewaardeerd;
• Wij volgen de Recruiter Code en gaan zorgvuldig met je persoonsgegevens om;
• Voor een volledig beeld van de zakelijke achtergrond van sollicitanten raadplegen we soms LinkedIn
• Deze vacature gaat offline na de sluitingsdatum, vergeet dus niet om de tekst te downloaden en op te slaan. Het kan zijn dat na deze datum deze vacature nog (onbedoeld) vindbaar is op diverse jobboards. De sluitingsdatum op werkenvoornederland.nl is leidend;
• Het kan voorkomen dat de sollicitatiepagina niet werkt, het kan aan de browser liggen. Probeer in dat geval de sollicitatiepagina in een andere browser te openen.